La direction de la Nature et de l'Eau est la gardienne scientifique de la Nature et de la Biodiversité.
Elle étudie et inventorie la flore et la faune pour améliorer la connaissance des espèces protégées ou menacées.
Son rôle consiste aussi à exercer la surveillance et de communiquer sur les espèces invasives.
Elle exerce une mission de conseil et d'expertise sur les espèces et leurs habitats, les qualités biologiques des sites naturels et l'incidence que peuvent revêtir des projets humains dans ces milieux de biodiversité.
La direction de la Nature et de l'Eau réalise le suivi sanitaire de la faune sauvage et analyse la dynamique de ses déplacements.
Elle réalise également l'état des lieux des eaux de surface pour apprécier sa qualité biologique et étudie la configuration des cours d'eau.
